2017-10-02 06:31 AM
Hello
The size of the /var/lib/pgsql database on our standalone Malware Appliance is very large.
Currently it is 40GB.
Does anyone know of any settings or maintainance jobs that control the size of this database?
total 64
drwx------. 2 postgres postgres 8192 Oct 21 2015 1
drwx------. 2 postgres postgres 8192 Oct 21 2015 12772
drwx------. 2 postgres postgres 8192 Oct 2 03:07 12780
drwx------. 2 postgres postgres 12288 Oct 2 04:59 16385
drwx------. 2 postgres postgres 6 Oct 2 09:54 pgsql_tmp
[root@XXXXX-MAL base]# du -hx . --max-depth=1
6.0M ./1
6.0M ./12772
6.1M ./12780
40G ./16385
0 ./pgsql_tmp
40G .
[root@XXXXX-MAL base]# pwd
/var/lib/pgsql/9.1/data/base
Here is a listing of the directory:
[root@XXXXXX-MAL 16385]# ls -latrh
total 40G
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12582
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12581
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12580
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12578
-rw-------. 1 postgres postgres 40K Oct 21 2015 12577
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12597
-rw-------. 1 postgres postgres 32K Oct 21 2015 12592
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12588
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12584
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12693
-rw-------. 1 postgres postgres 24K Oct 21 2015 12643
-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12634
-rw-------. 1 postgres postgres 96K Oct 21 2015 12609
-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12603
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12599
-rw-------. 1 postgres postgres 512 Oct 21 2015 pg_filenode.map
-rw-------. 1 postgres postgres 56K Oct 21 2015 12737
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12708
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12704
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12700
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12696
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12585
-rw-------. 1 postgres postgres 4 Oct 21 2015 PG_VERSION
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12654
-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12652
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12586
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12569
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12568
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12561
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12554
-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12552
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12620
-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12618
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12589
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12538
-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12535
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-rw-------. 1 postgres postgres 32K Oct 21 2015 12576
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-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12559
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-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12630
-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12744
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12742
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-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12595
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-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12608
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12606
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12605
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12602
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12601
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12615
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12614
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12613
-rw-------. 1 postgres postgres 264K Oct 21 2015 12611
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-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12626
-rw-------. 1 postgres postgres 232K Oct 21 2015 12624
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12639
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12638
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12637
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12636
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12633
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12632
-rw-------. 1 postgres postgres 120K Oct 21 2015 12629
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12647
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12646
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12645
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12642
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12641
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12698
-rw-------. 1 postgres postgres 32K Oct 21 2015 12695
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12692
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12691
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12689
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12711
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12710
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12707
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12706
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12703
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 12702
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-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12722
-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12720
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12719
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-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12716
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-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12732
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12731
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-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12727
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12726
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12747
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12746
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-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12764
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12762
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12761
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-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12757
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12756
-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 12754
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12752
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 12751
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-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 16543
-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 21 2015 16540
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-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 21 2015 16607
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-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16395
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16396
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16397
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16521
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16523
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-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16556
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16567
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16699
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16700
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16701
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16702
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16412
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16572
-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 21 2015 16574
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 22 2015 12550
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 22 2015 16386
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 22 2015 16515
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 22 2015 16548
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 22 2015 16558
-rw-------. 1 postgres postgres 8.0K Oct 22 2015 16561
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-rw-------. 1 postgres postgres 0 Oct 2 04:24 92790
-rw-------. 1 postgres postgres 24K Oct 2 04:25 12529_fsm
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-rw-------. 1 postgres postgres 24K Oct 2 04:26 12527_fsm
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-rw-------. 1 postgres postgres 1.1M Oct 2 10:26 16455_fsm
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-rw-------. 1 postgres postgres 72K Oct 2 10:26 16631_fsm
-rw-------. 1 postgres postgres 680K Oct 2 10:27 16447_fsm
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-rw-------. 1 postgres postgres 1.0G Oct 2 10:27 16447
-rw-------. 1 postgres postgres 1.0G Oct 2 10:27 16458
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-rw-------. 1 postgres postgres 24K Oct 2 10:28 92813_fsm
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-rw-------. 1 postgres postgres 16K Oct 2 10:29 92749
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-rw-------. 1 postgres postgres 232K Oct 2 10:29 16629_fsm
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-rw-------. 1 postgres postgres 66M Oct 2 10:29 16613
-rw-------. 1 postgres postgres 423M Oct 2 10:29 16631
-rw-------. 1 postgres postgres 1.0G Oct 2 10:29 16842.3
-rw-------. 1 postgres postgres 1.0G Oct 2 10:29 16842.5
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-rw-------. 1 postgres postgres 1.0G Oct 2 10:29 16842.2
-rw-------. 1 postgres postgres 1.0G Oct 2 10:29 16842
-rw-------. 1 postgres postgres 477M Oct 2 10:29 16842.6
-rw-------. 1 postgres postgres 1.0G Oct 2 10:29 16842.1
2017-10-12 10:24 AM
Thanks Eric,
That is a great diagram.
In the end I managed to clean up the database manually.
I ssh'd to the box and then ran
su postgres
psql -h localhost spectrum spectrum -a -f /tmp/cleanup-malware.sql
This file contained the sql commands to remove events.
It should be noted that events are made up of meta, and meta is made up of metavalues.
You need to delete these in reverse to get over the foreign key constraints in the database.
I also had to specify each day in turn as there were a large number of rows involved in the database.
delete from metavalue where metavalue.meta_id in (select id from meta where meta.event_id in (select id from events where whenarchiveddate <'2017-08-14'));
...
delete from metavalue where metavalue.meta_id in (select id from meta where meta.event_id in (select id from events where whenarchiveddate <'2017-09-30'));
(delete from meta where meta.event_id in (select id from events where whenarchiveddate <'2017-08-14'));
...
(delete from meta where meta.event_id in (select id from events where whenarchiveddate <'2017-09-30'));
(delete from events where whenarchiveddate <'2017-08-14'));
...
(delete from events where whenarchiveddate <'2017-09-30'));
The following query returned the size of the database before and after:
spectrum=> SELECT
relname AS objectname,
relkind AS objecttype,
reltuples AS "#entries", pg_size_pretty(relpages::bigint*8*1024) AS size
FROM pg_class
WHERE relpages >= 8
ORDER BY relpages DESC;
objectname | objecttype | #entries | size
---------------------------------+------------+-------------+---------
metavalue | r | 1.23679e+08 | 9664 MB
metavalue_value_lower_idx | i | 1.23679e+08 | 5419 MB
meta | r | 7.08515e+07 | 4166 MB
metavalue_metaid_idx | i | 1.23679e+08 | 3481 MB
metavalue_pkey | i | 1.23679e+08 | 3481 MB
meta_nameeventid_idx | i | 7.08515e+07 | 2742 MB
influences | r | 7.67044e+06 | 2620 MB
meta_pkey | i | 7.08515e+07 | 1629 MB
meta_eventid_idx | i | 7.08515e+07 | 1629 MB
influences_iockey_idx | i | 7.67044e+06 | 901 MB
files | r | 92921 | 865 MB
influences_eventid_idx | i | 7.67044e+06 | 262 MB
influences_fileentryid_idx | i | 7.67044e+06 | 262 MB
influences_pkey | i | 7.67044e+06 | 259 MB
events | r | 1.07553e+06 | 151 MB
pg_toast_16447 | t | 765 | 70 MB
files_idx_dateadded_digest | i | 92921 | 57 MB
files_idx_digest | i | 92921 | 51 MB
files_idx_name | i | 92921 | 42 MB
files_name_lower_idx | i | 92921 | 42 MB
event_ondemandjobentryid_idx | i | 1.03254e+06 | 25 MB
spectrum=> vacuum full;
WARNING: skipping "pg_authid" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_database" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_tablespace" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_pltemplate" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_auth_members" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_shdepend" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_shdescription" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_db_role_setting" --- only superuser can vacuum it
VACUUM
spectrum=> SELECT
relname AS objectname,
relkind AS objecttype,
reltuples AS "#entries", pg_size_pretty(relpages::bigint*8*1024) AS size
FROM pg_class
WHERE relpages >= 8
ORDER BY relpages DESC;
objectname | objecttype | #entries | size
---------------------------------+------------+-------------+---------
metavalue | r | 1.38876e+07 | 851 MB
metavalue_value_lower_idx | i | 1.38876e+07 | 477 MB
meta | r | 6.09655e+06 | 338 MB
metavalue_pkey | i | 1.38876e+07 | 298 MB
metavalue_metaid_idx | i | 1.38876e+07 | 298 MB
meta_nameeventid_idx | i | 6.09655e+06 | 221 MB
influences | r | 671291 | 145 MB
meta_pkey | i | 6.09655e+06 | 131 MB
meta_eventid_idx | i | 6.09655e+06 | 131 MB
files | r | 68054 | 65 MB
influences_iockey_idx | i | 671291 | 49 MB
influences_eventid_idx | i | 671291 | 14 MB
influences_fileentryid_idx | i | 671291 | 14 MB
influences_pkey | i | 671291 | 14 MB
events | r | 81826 | 11 MB
files_idx_dateadded_digest | i | 68054 | 4528 kB
files_idx_digest | i | 68054 | 3952 kB
files_name_lower_idx | i | 68054 | 3696 kB
files_idx_name | i | 68054 | 3696 kB
events_pkey | i | 81826 | 1808 kB
event_ondemandjobentryid_idx | i | 81826 | 1808 kB
event_whenarchived_idx | i | 81826 | 1808 kB
files_pkey | i | 68054 | 1504 kB
files_dateadded_idx | i | 68054 | 1504 kB
files_event_id_idx | i | 68054 | 1504 kB
pg_attribute | r | 3113 | 472 kB
pg_proc | r | 2342 | 456 kB
pg_depend | r | 6521 | 384 kB
pg_description | r | 3276 | 232 kB
pg_collation | r | 869 | 216 kB
pg_depend_depender_index | i | 6521 | 216 kB
pg_depend_reference_index | i | 6521 | 216 kB
pg_proc_proname_args_nsp_index | i | 2342 | 184 kB
pg_statistic | r | 493 | 176 kB
pg_attribute_relid_attnam_index | i | 3113 | 176 kB
pg_class | r | 462 | 136 kB
pg_attribute_relid_attnum_index | i | 3113 | 120 kB
pg_description_o_c_o_index | i | 3276 | 120 kB
pg_operator | r | 706 | 104 kB
pg_rewrite | r | 101 | 96 kB
pg_type | r | 412 | 80 kB
pg_proc_oid_index | i | 2342 | 72 kB
pg_class_relname_nsp_index | i | 462 | 64 kB
(43 rows)
2017-10-09 10:08 AM
Part of the issue was having a large number of events being generated by the malware appliance. I created some application rules to whitelist known good traffic. This would then not be scanned by the malware appliance and as a result fewer false positives were reported.
2017-10-10 12:26 PM
Would this flow have helped you detect what options you could change/filter to modify the false positives in the MA appliance?
2017-10-12 10:24 AM
Thanks Eric,
That is a great diagram.
In the end I managed to clean up the database manually.
I ssh'd to the box and then ran
su postgres
psql -h localhost spectrum spectrum -a -f /tmp/cleanup-malware.sql
This file contained the sql commands to remove events.
It should be noted that events are made up of meta, and meta is made up of metavalues.
You need to delete these in reverse to get over the foreign key constraints in the database.
I also had to specify each day in turn as there were a large number of rows involved in the database.
delete from metavalue where metavalue.meta_id in (select id from meta where meta.event_id in (select id from events where whenarchiveddate <'2017-08-14'));
...
delete from metavalue where metavalue.meta_id in (select id from meta where meta.event_id in (select id from events where whenarchiveddate <'2017-09-30'));
(delete from meta where meta.event_id in (select id from events where whenarchiveddate <'2017-08-14'));
...
(delete from meta where meta.event_id in (select id from events where whenarchiveddate <'2017-09-30'));
(delete from events where whenarchiveddate <'2017-08-14'));
...
(delete from events where whenarchiveddate <'2017-09-30'));
The following query returned the size of the database before and after:
spectrum=> SELECT
relname AS objectname,
relkind AS objecttype,
reltuples AS "#entries", pg_size_pretty(relpages::bigint*8*1024) AS size
FROM pg_class
WHERE relpages >= 8
ORDER BY relpages DESC;
objectname | objecttype | #entries | size
---------------------------------+------------+-------------+---------
metavalue | r | 1.23679e+08 | 9664 MB
metavalue_value_lower_idx | i | 1.23679e+08 | 5419 MB
meta | r | 7.08515e+07 | 4166 MB
metavalue_metaid_idx | i | 1.23679e+08 | 3481 MB
metavalue_pkey | i | 1.23679e+08 | 3481 MB
meta_nameeventid_idx | i | 7.08515e+07 | 2742 MB
influences | r | 7.67044e+06 | 2620 MB
meta_pkey | i | 7.08515e+07 | 1629 MB
meta_eventid_idx | i | 7.08515e+07 | 1629 MB
influences_iockey_idx | i | 7.67044e+06 | 901 MB
files | r | 92921 | 865 MB
influences_eventid_idx | i | 7.67044e+06 | 262 MB
influences_fileentryid_idx | i | 7.67044e+06 | 262 MB
influences_pkey | i | 7.67044e+06 | 259 MB
events | r | 1.07553e+06 | 151 MB
pg_toast_16447 | t | 765 | 70 MB
files_idx_dateadded_digest | i | 92921 | 57 MB
files_idx_digest | i | 92921 | 51 MB
files_idx_name | i | 92921 | 42 MB
files_name_lower_idx | i | 92921 | 42 MB
event_ondemandjobentryid_idx | i | 1.03254e+06 | 25 MB
spectrum=> vacuum full;
WARNING: skipping "pg_authid" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_database" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_tablespace" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_pltemplate" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_auth_members" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_shdepend" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_shdescription" --- only superuser can vacuum it
WARNING: skipping "pg_db_role_setting" --- only superuser can vacuum it
VACUUM
spectrum=> SELECT
relname AS objectname,
relkind AS objecttype,
reltuples AS "#entries", pg_size_pretty(relpages::bigint*8*1024) AS size
FROM pg_class
WHERE relpages >= 8
ORDER BY relpages DESC;
objectname | objecttype | #entries | size
---------------------------------+------------+-------------+---------
metavalue | r | 1.38876e+07 | 851 MB
metavalue_value_lower_idx | i | 1.38876e+07 | 477 MB
meta | r | 6.09655e+06 | 338 MB
metavalue_pkey | i | 1.38876e+07 | 298 MB
metavalue_metaid_idx | i | 1.38876e+07 | 298 MB
meta_nameeventid_idx | i | 6.09655e+06 | 221 MB
influences | r | 671291 | 145 MB
meta_pkey | i | 6.09655e+06 | 131 MB
meta_eventid_idx | i | 6.09655e+06 | 131 MB
files | r | 68054 | 65 MB
influences_iockey_idx | i | 671291 | 49 MB
influences_eventid_idx | i | 671291 | 14 MB
influences_fileentryid_idx | i | 671291 | 14 MB
influences_pkey | i | 671291 | 14 MB
events | r | 81826 | 11 MB
files_idx_dateadded_digest | i | 68054 | 4528 kB
files_idx_digest | i | 68054 | 3952 kB
files_name_lower_idx | i | 68054 | 3696 kB
files_idx_name | i | 68054 | 3696 kB
events_pkey | i | 81826 | 1808 kB
event_ondemandjobentryid_idx | i | 81826 | 1808 kB
event_whenarchived_idx | i | 81826 | 1808 kB
files_pkey | i | 68054 | 1504 kB
files_dateadded_idx | i | 68054 | 1504 kB
files_event_id_idx | i | 68054 | 1504 kB
pg_attribute | r | 3113 | 472 kB
pg_proc | r | 2342 | 456 kB
pg_depend | r | 6521 | 384 kB
pg_description | r | 3276 | 232 kB
pg_collation | r | 869 | 216 kB
pg_depend_depender_index | i | 6521 | 216 kB
pg_depend_reference_index | i | 6521 | 216 kB
pg_proc_proname_args_nsp_index | i | 2342 | 184 kB
pg_statistic | r | 493 | 176 kB
pg_attribute_relid_attnam_index | i | 3113 | 176 kB
pg_class | r | 462 | 136 kB
pg_attribute_relid_attnum_index | i | 3113 | 120 kB
pg_description_o_c_o_index | i | 3276 | 120 kB
pg_operator | r | 706 | 104 kB
pg_rewrite | r | 101 | 96 kB
pg_type | r | 412 | 80 kB
pg_proc_oid_index | i | 2342 | 72 kB
pg_class_relname_nsp_index | i | 462 | 64 kB
(43 rows)